Infiziert nun erneut ein Phage eine Bakterie, dockt diese RNA an die vom Phagen ins Bakteriengenom eingebauten eigene Bauanleitung und vermittelt dem Protein Cas, diesen Abschnitt herauszuschneiden. Damit wehrt sich die Bakterie gegen bekannte Phagen und protokolliert so dauernd, welchen Viren sie ausgesetzt war. Die Schweizer Forscher haben das System modifiziert.